Ein Pokémon in der Zeit zurück gereist um die kostbaren Zahnräder der Zeit zu stehlen die in den entferntesten Winkeln der Welt verborgen sind.

Es liegt am Spieler ein Erkundungsteam aufzustellen das es mit diesem Gegner aufnimmt und verhindert dass die die Welt ins Dunkel stürzt. Das Team muss Hilfsmittel oder flüchtige Outlaws zu finden immer wieder mit Hilfe einer ganzen Schar nützlicher Pokémon.